Upravu Fakulteta čine dekan i prodekani. Bira ih Fakultetsko vijeće tajnim glasanjem, a mandat traje dvije godine. Ista osoba može obnašati dužnost dekana u najviše dva mandata. Dekan za svoj rad odgovara Fakultetskome vijeću i rektoru.
Dekan
prof. dr. sc. Vedran Bilas
Prodekan za nastavu
prof. dr. sc. Bojan Trkulja
(01) 6129 800
Prodekanica za studente
izv. prof. dr. sc. Ana Sušac
(01) 6129 800
Prodekan za istraživanje i inovacije
prof. dr. sc. Stjepan Bogdan
(01) 6129 800
Prodekan za poslovanje i digitalizaciju
prof. dr. sc. Jadranko Matuško
(01) 6129 642