Bioinformatics 2
Opis predmeta
Ovaj predmet upoznaje studente s: (i) osnovnim probabilističkim grafičkim modelima poput slučajnih markovljevih polja, Bayesovih mreža (ii) skrivenim Markovljevim modelima (iii) Bayesovim i kauzalnim zaključivanjem (iv) primjenom stečenih znanja na biološkim problemima.
Ishodi učenja
- Objasniti osnovne probabilističke grafičke modele poput slučajnih markovljevih polja i Bayesovih mreža
- Objasniti slučajne markovljeve modele
- Upotrijebiti Bayesovo i kauzalno zaključivanje za rješavanje problema
- Primijeniti osnovne probabilističke grafičke modele na poznatim problemima u biologiji
Oblici nastave
Predavanja
Predavanja u učionici.
Samostalni zadaciProjektni timski rad.
Način ocjenjivanja
Kontinuirana nastava | Ispitni rok | |||||
---|---|---|---|---|---|---|
Vrsta provjere | Prag | Udio u ocjeni | Prag | Udio u ocjeni | ||
Seminar/Projekt | 0 % | 40 % | 0 % | 40 % | ||
Međuispit: Pismeni | 0 % | 25 % | 0 % | |||
Završni ispit: Pismeni | 40 % | 35 % | ||||
Ispit: Pismeni | 40 % | 60 % |
Tjedni plan nastave
- Grafički modeli za računalnu biologiju
- Grafički modeli za računalnu biologiju
- Grafički modeli za računalnu biologiju
- Grafički modeli za računalnu biologiju
- Grafički modeli za računalnu biologiju
- Skriveni Markovljevi modeli za računalnu biologiju
- Skriveni Markovljevi modeli za računalnu biologiju
- Međuispit
- Skriveni Markovljevi modeli za računalnu biologiju
- Bayesovo zaključivanje za računalnu biologiju
- Bayesovo zaključivanje za računalnu biologiju
- Bayesovo zaključivanje za računalnu biologiju
- Primjena na složene biološke sustave
- Primjena na složene biološke sustave
- Završni ispit
Studijski programi
Sveučilišni diplomski
[FER3-EN] Data Science - profil
Recommended elective courses
(3. semestar)
Literatura
(.), Probabilistic Graphical Models : Principles and Techniques, Daphne Koller and Nir Friedman,
Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh, Graeme Mitchison (.), Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge University Press
Za studente
Izvedba
ID 223007
Zimski semestar
5 ECTS
R3 Engleski jezik
R1 E-učenje
30 Predavanja
0 Seminar
0 Auditorne vježbe
5 Laboratorijske vježbe
0 Konstrukcijske vježbe
Ocjenjivanje
90 izvrstan
75 vrlo dobar
60 dobar
50 dovoljan