- Laboratorij za robotiku i inteligentne sustave upravljanja - LARICS
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Zdenko Kovačić
http://larics.rasip.fer.hr
- Laboratorij za podvodne sustave i tehnologije - LAPOST
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Zoran Vukić
http://labust.fer.hr
- Laboratorij potrošaču usmjerenog računarstva - CCL
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Siniša Srbljić
http://ccl.fer.hr
- Laboratorij električne strojeve, učinsku elektroniku i pogone - LESUEP
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Damir Žarko
- Laboratorij za raspoznavanje uzoraka i biometrijske sigurnosne sustave - RUBIOSS
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Slobodan Ribarić
http://rubioss.zemris.fer.hr
- Laboratorij za mehatroničke sustave - LAMES
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Fetah Kolonić
- Laboratorij za tehnologije orijentirane ljudskim likovima - HOTlab
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Igor S. Pandžić
http://hotlab.fer.hr
- Laboratorij za statističko modeliranje i optimizaciju - SMOLA
Voditelj laboratorija: doc. dr. sc. Nikica Hlupić
- Laboratorij za primijenjenu optiku - AOLab
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Zvonimir Šipuš
- Auralizacijski laboratorij - AuraLab
Voditelj laboratorija: prof. dr. sc. Hrvoje Domitrović
